Wing Commander — это симулятор космического боя, перемежающийся роликами с живыми боевиками. Игровой процесс включает в себя выполнение миссий и уничтожение вражеских кораблей, командир крыла III отказался от выдачи медалей после таких миссий и больше полагался на кат-сцены, чтобы продвигать историю, гораздо больше используя технологию компакт-дисков. Как человек, отдающий приказы, Блэр часто выбирает, на каком корабле он будет летать, какие ракеты он будет нести и какого ведомого (ведомых) он возьмет с собой. Как и в Wing Commander, некоторых ведомых можно навсегда убить в бою. Собственный позывной Блэра оставался настраиваемым