Игра начинается в Картидже, штат Мичиган, когда Имани Грей и четыре новобранца IPCA отправляются, чтобы найти Лоуренса Муджари и устранить угрозу Французской анархистской освободительной армии (ALA), в то время как Габриэль Логан и Лиан Син исследуют Уганду, а Гэри Стоунман исследует Италию. Агенты IPCA срывают планы ALA. Муджари выздоровел и находится под медицинским наблюдением. Тем временем Стоун обнаруживает, что Коза Ностра хочет получить вирус, чтобы использовать его в качестве инструмента в мафиозных войнах. Поэтому Стоун отправился в Пескару, чтобы убить главу мафии Дмитрия Алексуполоса. Убийство Дмитрия помешало мафиозной семье получить доступ к Сифонному фильтру.