Игрок возглавляет команду из четырех человек (три товарища по команде, управляемых ИИ) морских котиков США, выполняя 12 миссий в четырех регионах: Аляска, Таиланд, Конго и Туркменистан в 2006 и 2007 годах. В одиночных миссиях команды могут говорить с помощью прилагаемой USB-гарнитуры или через экранное меню, если дополнительная гарнитура SOCOM не была приобретена. Типичные миссии состоят из убийства террористов, спасения заложников, получения разведданных или уничтожения террористических баз. Кодовое имя игрового персонажа - Кахуна, а кодовые имена товарищей по команде NPC - Бумер, Призрак и Шут. Команда разделена на две подгруппы: «Альфа» и «Браво». Группа «Альфа» состоит из игрока и Бумера, а остальные двое составляют Браво. Команды можно отдавать как отдельным лицам, так и целой группе, например, можно попросить команду Браво оставаться на месте, пока игрок разведывает территорию с помощью Бумера. Однако игрок не может путешествовать по карте в одиночку: когда Кахуна находится слишком далеко от Бумера, ...