Marvel vs. Capcom Origins предлагает как игровой процесс Marvel Super Heroes один на один с уникальной системой Infinity Gem, так и бойню два на два, как в оригинальной Marvel vs. Capcom: Clash of Super Heroes, с системой тегов, передачи и дикая дуэтная атака. Marvel vs. Capcom Origins предлагает множество функций, никогда ранее не встречавшихся в этих играх, и включает расширенную GGPO онлайн-игру с лобби для 8 игроков и режимом зрителя, графическими улучшениями HD, динамическими испытаниями и сохранением повторов.