Он схватил Марио и его друзей в погоне за кристаллом, который группа собрала, когда тот упал с неба, и он, не колеблясь, уменьшил их до миниатюрных размеров, чтобы избавиться от них и получить в свои руки остальные четыре кристалла. Мини-герои должны найти кристаллы раньше него, пробираясь через гигантские среды, заполненные огромными существами. Одиночная кампания проходит в пяти разных местах, каждое из которых заканчивается боссом. Как обычно, игрокам предстоит собирать монеты и звезды, одновременно избегая опасностей, таких как растения-пираньи и другие классические существа из вселенной Марио.