«Гарри Поттер и Принц-полукровка» представляет собой исследование Хогвартса и наложение заклинаний на объекты в школе, как и в его предшественнике. Игра также включает в себя многопользовательские игры, классы, разное время суток, квиддич, дуэли волшебников и приготовление зелий. Карта мародеров включена в игру, и по мере продвижения открываются другие части школы. Гарри также может позвонить Почти Безголовому Нику, чтобы показать ему школу. Гарри — главный игровой персонаж в игре, но Рон и Джинни также доступны на двух уровнях.