На протяжении всей франшизы Fate пары мастеров и героических духов, также известных как слуги, сражались на протяжении всей истории в серии Войн Святого Грааля, причем победивший дуэт получал древний артефакт, исполняющий желания. Fate/Samurai Remnant продолжает серию. Эпическая Война Святого Грааля в четвертом году эры Кэйан, период Эдо, Япония. Прошло несколько десятилетий с момента окончания бурной, пропитанной кровью эпохи, и пока люди, наконец, наслаждаются миром и спокойствием, битва между семью парами хозяев и слуг вот-вот начнется, поскольку «Ритуал растущей луны» разворачивается в Тени. Именно здесь герой игры, Миямото Иори, молодой человек из Асакуса, оказывается втянутым в насилие вместе со своей служанкой Сэйбер, когда они сражаются за то, чтобы стать последней парой, оставшейся, чтобы получить исполнителя желаний, «Сосуд прибывающей луны». ».